2015 – 2016 sezonu fikstür çekilişi ile birlikte Federasyon Kupası eleme grupları kura çekilişini de yapıldı.  Abdi İpekçi Spor Salonu'nda gerçekleştirilen kura çekiminde, kupada mücadele edecek 24 takımın grupları belirlendi. Takımlar 3'erli olmak üzere 8 grupta mücadele edecek.

Federasyon Kupası'nda, eleme grupları şöyle oluştu:

A Grubu: Yalova VIP, Nevşehir HBVÜ, 24. Takım

B Grubu: OGM Orman, Ferko Ilgaz, Çankaya Üniversitesi

C Grubu: Nevşehir GHSİM, Mudanya Belediye Dinçspor, Mersin Büyükşehir Belediye Gelişim

D Grubu: Tekirdağ Enerji, Edremit Belediye Gürespor, Alanya Belediyespor

E Grubu: Fenerbahçe Gelişim, Ses Okulları 55 Gençlik, Osmaniye Gençlik

F Grubu: Urla Belediyespor, Bursa Büyükşehir Belediyespor, Bakospor

G Grubu: Mersin Basketbol, TED Ankara Kolejliler, Anadolu Üniversitesi

H Grubu: Mersin Üniversitesi, Mersin Kurtuluş, İstanbulgücü